浙江省长三角基础设施科学研究院拥有工程勘察乙级、市政行业设计乙级、建筑行业设计乙级、检验检测机构资质、建设工程质量检测机构资质、测绘乙级、工程咨询备案、司法鉴定备案等资质证书，同时具备质量管理体系认证、职业健康安全管理体系认证、环境管理体系认证、信息安全管理体系认证、信息技术服务管理体系认证等体系认证证书。
